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Nature:你的大腦衰老速度受這64個基因影響

2025-03-16 08:06
來源:澎湃新聞·澎湃號·湃客
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一水 發(fā)自 凹非寺

量子位 | 公眾號 QbitAI

你的大腦衰老速度,原來受這64個基因影響!

事情是這樣的。

根據(jù)Nature最新報(bào)道,科學(xué)家們通過利用AI模型分析大量腦部掃描和遺傳數(shù)據(jù),確定了64個影響大腦衰老速度的基因,并指出了13種潛在的抗衰老藥物。

相關(guān)研究發(fā)表在最新一期Science子刊《Science Advances》上。

按照Nature的評價(jià),這是嘗試確定影響器官衰退遺傳因素這一研究領(lǐng)域里:

迄今為止規(guī)模最大的一次嘗試

都柏林圣三一學(xué)院的神經(jīng)科學(xué)家Agustín Ibá?ez夸贊道:

此項(xiàng)研究意義重大,因?yàn)樗鼈兛赡転檠邪l(fā)新的大腦抗衰藥物鋪平道路。

具體研究過程

有越來越多的證據(jù)表明,大腦衰老與神經(jīng)退行性疾病(認(rèn)知或軀體的功能障礙)和死亡風(fēng)險(xiǎn)的增加有關(guān)。

因此,本研究首先試圖找出導(dǎo)致大腦衰老的因素,然后基于此找出應(yīng)對之道。

具體而言,科學(xué)家們將BAG(Brain Age Gap,大腦年齡差距)作為大腦衰老的標(biāo)志,這是指大腦預(yù)測年齡和實(shí)際年齡之間的差距。

通過分析大量數(shù)據(jù),他們想找出哪些基因造成了人們的BAG差異。

第一步,他們找來了29097名健康參與者的UKB數(shù)據(jù)集(英國生物庫),以此訓(xùn)練了7個AI模型進(jìn)行腦齡估計(jì)。

這里要補(bǔ)充一下,過去幾十年,通過磁共振成像(MRI)和機(jī)器學(xué)習(xí)模型來估計(jì)大腦年齡的研究不在少數(shù),這些模型使用健康參與者的MRI數(shù)據(jù)和各種監(jiān)督學(xué)習(xí)算法來訓(xùn)練回歸模型,從而預(yù)測個體的大腦年齡。

接下來,他們使用3227名健康和6637名腦部疾病受試者的數(shù)據(jù),以及來自ADNI、PPMI和IXI的外部MRI數(shù)據(jù)來進(jìn)行驗(yàn)證。

(ADNI、PPMI和IXI是三個不同的神經(jīng)科學(xué)研究項(xiàng)目,它們提供了大量的數(shù)據(jù)和資源,用于研究阿爾茨海默病和其他神經(jīng)退行性疾病。)

所使用的評估指標(biāo)包括MAE(平均絕對誤差)、MSE(均方誤差)、R2(決定系數(shù))和Pearson R(皮爾遜相關(guān)系數(shù))。

過程中他們發(fā)現(xiàn),三維視覺Transformer(3D-ViT)模型在估計(jì)大腦年齡方面優(yōu)于其他模型,于是被用于后續(xù)分析中測量BAG。

第二步,他們對31520名健康參與者進(jìn)行了GWAS(Genome-Wide Association Studies,全基因組關(guān)聯(lián)研究),這是一種用于識別基因組中遺傳變異與特定性狀或疾病之間關(guān)聯(lián)的研究方法。

換句話說,GWAS在這里被用來確定與BAG相關(guān)的遺傳變異。

然后他們利用GWAS的結(jié)果來進(jìn)一步探索BAG的潛在影響。

具體是指,通過遺傳相關(guān)性和孟德爾隨機(jī)化(MR,一種基于遺傳變異的因果推斷方法)方法,他們研究了BAG對18種腦部疾病和8個表型特征的因果關(guān)系。

盡管大多數(shù)的因果關(guān)系并不顯著,但研究發(fā)現(xiàn)BAG對智力有顯著的因果影響。

通過藥物靶點(diǎn)孟德爾隨機(jī)化、表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)(eQTL,基因表達(dá)水平與特定基因組位置的遺傳變異)及蛋白質(zhì)數(shù)量性狀位點(diǎn)(pQTL,蛋白質(zhì)水平與遺傳變異之間的關(guān)聯(lián))數(shù)據(jù)的共定位分析,研究確定了64個可藥物治療的基因。

(共定位分析是一種統(tǒng)計(jì)方法,用于檢驗(yàn)兩個或多個表型(例如疾病或分子表型)是否由同一區(qū)域的同一個因果變異位點(diǎn)驅(qū)動,幫助我們理解遺傳變異如何影響表型。)

他們發(fā)現(xiàn),這些基因在生物學(xué)上的功能與一些特定的生物化學(xué)通路有關(guān)(圖F),包括程序性細(xì)胞死亡、血小板信號傳導(dǎo)和聚集、細(xì)胞外基質(zhì)組織、血管壁細(xì)胞表面相互作用和凋亡。

換句話說,一旦針對這些通路中的關(guān)鍵基因進(jìn)行藥物開發(fā),可能有助于調(diào)節(jié)這些過程,從而對抗衰老或治療相關(guān)疾病。

其中,MAPT、TNFSF12、GZMB、SIRPB1、GNLY、NMB和C1RL這七個基因被認(rèn)為是大腦衰老的強(qiáng)因果候選者。

進(jìn)一步的全基因組掃描探索了這些基因與44個額外特征的關(guān)聯(lián),再次驗(yàn)證了這些靶點(diǎn)的合理性。

還發(fā)現(xiàn)了466種潛在抗衰藥物

接下來,研究進(jìn)行了藥物再利用分析。

具體而言,他們利用藥物-基因相互作用數(shù)據(jù)庫DGIdb,發(fā)現(xiàn)有466種藥物具備抗衰潛力,這些藥物針對的是64個已鑒定基因中的29個,這些藥物要么已經(jīng)獲得批準(zhǔn),要么正在進(jìn)行臨床開發(fā)。

進(jìn)一步篩選發(fā)現(xiàn),其中有29種藥物顯示出對延緩大腦衰老有潛在作用。

這29種藥物中,包括達(dá)沙替尼、雙氯芬酸、地丹諾辛在內(nèi)的20種藥物的抗衰潛力已被前人研究所提及。

目前,針對這20種藥物中的13種(包括膽鈣化醇、達(dá)沙替尼、雙氯芬酸等),研究人員已經(jīng)在抗衰老臨床試驗(yàn)中進(jìn)行了測試或正在測試。

不過需要提醒,由于多數(shù)研究參與者來自歐洲,所以并不清楚這些發(fā)現(xiàn)是否適用于更多基因多樣性的人群。

參考鏈接:

https://www.nature.com/articles/d41586-025-00766-0

— 完 —

原標(biāo)題:《Nature:你的大腦衰老速度受這64個基因影響》

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