5月20日，傳染病預防控制國家重點實驗室公眾號刊登一篇題為《新冠肺炎重癥患者鼻咽部過度生長的“超級優勢致病性共生菌屬”可下行到肺部致病》的文章，稱研究發現SARS-CoV-2重癥患者的鼻咽微生物群多樣性喪失，且增長占比超過50%的鼻咽部細菌——超級優勢菌（Super-dominant Pathobiontic Bacteria，SDPG），可在疾病發展進程中侵入下呼吸道，導致患者出現繼發性細菌性肺炎。

文章指出，若要減少新冠患者的重癥率和死亡率，要考慮超級優勢菌的存在，并關注鼻咽部菌群失調問題。

中國醫學科學院學部委員、中國工程院院士、南開大學公共衛生與健康研究院院長、中國微生物學會理事長、傳染病預防控制專家徐建國向澎湃新聞（www.usamodel.cn）表示，過度生長的致病共生菌往往對多種抗生素耐藥，給治療帶來困難，是重癥和死亡的重要原因。“許多病毒性傳染病是始于病毒‘亡’于細菌，譬如甲流，我們對這一點忽略了。”

該文章援引的研究論文近期發表于《Spectrum Microbiology》雜志，題為《鼻咽部微生物群中的超級優勢病原菌導致COVID-19患者二次細菌感染（Super Dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota Cause Secondary Bacterial Infection in COVID-19 Patients）》。第一作者為中國疾病預防控制中心傳染病所研究員秦天，傳染病所徐建國院士為責任作者。

健康人的鼻咽部包括兩類細菌，一類是健康共生菌，一類是致病共生菌。致病共生菌在正常情況下和人共生，但具有致病潛力；在宿主免疫力低下等條件下，可導致疾病發生，也稱“兩面菌（two face bacteria）”。

超級優勢致病性共生菌屬（SDPG），指在流感病毒患者鼻咽部的致病共生菌（Pathobionts）過度增長，豐度（數量）占比超過菌群細胞總數50%的致病性菌屬。

該研究團隊對20例重癥和51例輕癥新冠患者開展上下呼吸道細菌宏分類學研究后發現，新冠肺炎輕度和重度患者的SDPG數量存在顯著差異。在輕癥患者中，10.8%的鼻咽部菌群和8.5%下呼吸道菌群有SDPG，沒有患者在這兩個區域同時出現SDPG。而在重癥患者中，40.7%的鼻咽部菌群和63.2%的下呼吸道菌群有SDPG，其中30%重癥患者，從鼻咽拭子和肺泡灌洗液標本分離菌株的基因組序列完全一致，這說明這些超級優勢致病共生菌可在疾病發展進程中，從鼻咽部下行到肺泡造成感染，導致重癥或者死亡。

對SARS-CoV-2輕重癥患者上呼吸道和下呼吸道樣本的測序結果。MU指的是輕度COVID-19輕癥患者的上呼吸道；MD指COVID-19輕癥患者的下呼吸道；SU指COVID-19重癥患者的上呼吸道；SD指COVID-19重癥患者的下呼吸道

在新冠肺炎患者中發現具有下行能力的細菌包括，鮑曼不動桿菌、金黃色葡萄球菌、紋狀體棒狀桿菌等。其中，葡萄球菌、棒狀桿菌和不動桿菌是主要的SDPG。

對此，該研究認為，SARS-CoV-2重癥患者的鼻咽微生物群多樣性喪失，鼻咽微生物群中的SDPG可導致新冠重癥患者出現繼發性細菌感染，并加重肺炎，導致高死亡率。事實上，繼發性細菌感染，是目前病毒性肺炎（例如流感）重癥化，乃至導致死亡的最重要、最直接的原因之一。

澎湃新聞記者注意到，徐建國團隊也曾發表相關針對繼發性下呼吸道細菌感染的研究論文，提出超級優勢菌可在疾病發展進程中下行到肺泡造成感染，導致死亡。

該論文題為“鼻咽部超級優勢菌是流感患者繼發細菌感染的原因（Super-dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota as Causative Agents of Secondary Bacterial Infection in Influenza Patients）”，于2020年發表于期刊雜志《Emerging Microbes & Infections》。第一作者為中國疾病預防控制中心傳染病所研究員秦天，協和醫院李太生主任、傳染病所徐建國院士為責任作者。

為了證實鼻咽部超級優勢菌可下行到肺泡的理論，該研究團隊基于2017-2018年北京流感大流行期間的樣本開展對照試驗，利用16SrRNA基因V3-V4區域的高通量測序分析鼻咽部微生物群的分類組成。

研究人員從患者的咽拭子和肺泡灌洗液分離細菌后發現，61% 的重癥患者、24%的輕癥患者和29%健康人鼻咽部菌群具有SDPG。

同一患者，從鼻咽部和肺泡分離的菌株的基因組序列完全一致。也就是說，患者鼻咽部的超級優勢致病性共生菌屬可下行到肺泡，造成肺部感染。研究發現具有下行能力的細菌包括鮑曼不動桿菌、肺炎克雷伯菌、銅綠假單胞菌、紋狀體棒狀桿菌等。

從患者鼻咽部和肺泡灌洗液分離菌株的PFGE圖譜及基因組相同，圖源：傳染病預防控制國家重點實驗室網站

秦天對此認為，許多細菌是“兩面菌”，在一定的條件下可轉化為致病菌，是醫學細菌學研究的新課題。而責任作者之一，協和醫院李太生主任則表示，這個現象可能具有普遍意義，或對新型冠狀病毒肺炎的治療有參考意義。

目前，新冠疫情發展態勢仍未明朗。在南非發現奧密克戎變異株6個月后，擁有顯著免疫逃逸能力的一系列亞變體——BA.2、BA2.12.1、BA.4和BA.5正掀起新的疫情浪潮。

加州大學洛杉磯分校公共衛生學院流行病學系系主任張作風此前向澎湃新聞分析稱，三個新亞型的傳染性比BA.1和BA.2強，對免疫系統穿透率也比較高，但由于病毒停留在上呼吸道，大多不攻擊肺部，所以對重癥率和病死率的影響有限。

“新冠疫情發展到現在，防重癥、防死亡成為重中之重。”徐建國院士向澎湃新聞指出，鼻咽部菌群紊亂，一些細菌過度生長，數量上占絕對優勢。這些過度生長的致病共生菌，會有更多的機會，下行到肺泡，成為主要病原體，導致死亡，“它們往往對多種抗生素耐藥，給治療帶來困難，是重癥和死亡的重要原因，但過去我們并不知道這一點”。

徐建國院士表示，在與協和醫院李太生主任醫師合作之下，該團隊有機會同時比較患者鼻咽部和肺泡標本的細菌——將李太生團隊在患者入院時采集的鼻咽拭子分離的細菌，和患者住院后從肺泡標本分離的細菌進行比較，發現它們在基因組水平是一致的，“這個發現我們也非常吃驚，也坐實了我們的推論”。

對于目前新冠疫情的發展態勢，徐建國院士特別指出，老年人的基礎性疾病較多，免疫功能較低，發生菌群紊亂的可能性增大，這是自然現象，而目前還沒有調節鼻咽部菌群紊亂的制劑。他建議，老年患者注意口腔衛生，常漱口，“漱口可不斷改變口腔細菌生長的環境，或許能夠減少形成鼻咽部菌群紊亂的機會”。時，臨床醫生盡早關注鼻咽部菌群紊亂的問題，關注SDPG的現象，采取對應措施，預防SDPG的發生。

徐建國院士還呼吁科學家研究冠狀病毒和細菌相互作用的科學問題，為疫情防控提供新的知識和產品。

“細菌和病毒差別較大，是兩個學科，特點不同，研究者往往分屬兩個團隊。但細菌和病毒在人體是在一起的，包括鼻咽部、肺泡、腸道等。我們不應該在研究時只看細菌，不看病毒，或者只看病毒，不看細菌。新冠是人類歷史上從來沒有遇到過的傳染病。防控新冠，我們需要新的思維，新的理論，新的產品，應該具有整合醫學的理念，或許這是我們走出困境的一條思路。”他說。